Magasabb kezdeti költségek: A hagyományos tetőtéri napelemekhez képest a napelemes tetőcserepeknek gyakran magasabbak a kezdeti beruházási költségei.
Kissé alacsonyabb energiahatékonyság: A napelemes tetőcserepek energiaátalakítási hatékonysága általában valamivel alacsonyabb lehet, mint a szabványos napelem moduloké.
Szerelési szolgáltatások szűkössége: Jelenleg viszonylag kevés cég kínál napelemes tetőcserepek beszerelését, ami némi kellemetlenséget okozhat a szerelési folyamat során.
